O exame endoscópico do trato gastrointestinal consiste na avaliação interna dos seguintes órgãos: pela endoscopia digestiva alta conseguimos avaliar o esôfago, estômago e duodeno, e pela endoscopia digestiva baixa (colonoscopia) conseguimos avaliar o reto, cólon, céco e íleo. Através dele, podemos realizar procedimentos diagnósticos ou terapêuticos.

Durante os procedimentos com fins diagnósticos é possível avaliar a integridade da camada mais interna destes órgãos (mucosa), identificar possíveis alterações anatômicas, possíveis neoformações e avaliar o peristaltismo. Além da avaliação, realiza-se a coleta de fragmentos da camada mucosa a fim de realizar exames complementares como análise histopatológica, pesquisa de H. pylori e cultura com antibiograma.

Já pelo método terapêutico, é possível realizar a remoção de objetos que possam ter sido ingeridos pelo paciente, realizar a dilatação de áreas estenosadas e até realizar a remoção de nódulos que possam estar causando obstruções no trato gastrointestinal.